在整合了南平县各个武装力量之后，赵天云着手进行他的第二项改革举措，对县内各大地主、商户、生意加税。
此时的南平县，百分之九十以上是农民，但是全县大部分农民都是大地主家的佃户。大地主们已经控制着县里一半的土地，关键是这些土地缴纳的税赋大部分被这些大地主截留，光靠着另一半农民缴纳的赋税，难以支持全县的税收。
赵天云是从底层农民干起来的，自然知道其中的道道，他现在要扩充自己的实力，因此急需要钱，他便要对这些地主们下手。
赵天云敏锐意识到保甲长制度是代替原先乡镇里的村长、族长和乡贤制度好治理手段，如果能进一步细化方案，赵天云的手将插入每一个村、镇，真正掌握基层治理。赵天云联系到肖晨，汇报南平县的情况，申请在南平县实行推广保甲制度。
肖晨非常吃惊赵天云主动申请试行保甲制度。虽然在江西地区实行保甲制度效果非常好，国民党政府也曾计划将该制度推行到全国各地，但是从各地反应来看，都不是很积极甚至有些抵触。现在南平县主动申请实行，他自然大力欢迎，甚至专门抵达南平县和赵天云洽谈实施经验，企图将南平县作为一个新的试点单位和模范。赵天云则在吸取保甲经验的同时，侧面打听一些江西保甲示范区内的***管理手段。
在赵天云、肖晨联合推动下，南平县保甲示范先行县得以顺利通过并实施，赵天云正式在南平县进行保甲制度。南平县颁发保甲联保条例，联保就是各户之间联合作保，共具保结，互相担保不做通共之事，连坐就是1家有“罪“，9家举发，若不举发，10家连带坐罪。
在推荐保甲长名单时，在意识到保甲长的职责范围后，很多公正人士多不愿担任保甲长，一般不肖之徒又多以保甲长有利可图，百般钻营。赵天云自然不放过这样机会，大力推荐和安插自己人。
保甲制度只是赵天云打破原有体系的手段之一，他深层的目的，还是对县里的大地主和大商户入手。
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