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顺治十年（1653年）正月，福临下令要改变仅有满臣奏事的局面，此后，凡章奏，令满汉侍郎、卿以上会同奏进。福临阅读《通鉴》，问大臣历史上的各个圣明之君谁最优，陈名夏对他说唐太宗，而顺治帝以为明太祖的各种立法可以有利于后世。三月，赐太常卿汤若望号通玄教师。命令各部院奏事停用绿头牌。四月，亲自测试翰林官成克巩等人。此时，陈名夏案发生，二十八名汉官遭到训斥。五月，增置内三院汉大学士，院各二人。设立十三衙门，谕戒宦官干政，所设太监级不过四品。八月，将太宗皇帝的第十四女和硕公主下嫁平西王吴三桂之子吴应熊。二十四日，废除皇后为静妃。
顺治十一年（1654年）三月，皇三子玄烨（即康熙皇帝）生。六月，立科尔沁镇国公绰尔济女博尔济吉特氏为皇后。
顺治十二年（1655年）正月，修《顺治大训》，并且编纂《资政要览》。四月，下诏修《太祖圣训》、《太宗圣训》。五月，郑亲王济尔哈朗病逝。六月，福临封博果铎为和硕庄亲王。授汤若望为通政使。命名宫禁为紫禁城，后山为景山，西苑南台为瀛台。命内十三衙门立铁牌，严禁内监干政。
顺治十三年（1656年）八月二十五日董鄂妃被册为“贤妃”，十二月，晋封为皇贵妃。
顺治十四年（1657年），福临开始接触和尚，成为佛教信徒。这年深秋，福临驾幸南海子，在太监的带领下到了海会寺，见到了临济宗龙池派和尚憨璞生性聪慧，福临和他交谈非常契合，因此对佛教产生了兴趣，所以于十月四日于南苑万善殿召见憨璞，以后又不断召见，详细询问佛教界的德高望重的人。他得悉龙池派内许多著名和尚的情形，对他们非常向往。
顺治十五年（1658年）诰封汤若望为光禄大夫，秩为正一品。九月，福临遣使赴江南湖州报恩寺召名僧玉林琇来京，玉林琇清高自持，多次辞谢不应召，使者不许。
顺治十六年（1659年）二月，玉林琇入京面见福临。福临当即封他为“大觉禅师”，并以禅门师长礼待玉林琇，自称弟子，并请求他起法名。玉林琇再三推辞，福临不许，并要用丑些的字眼命名，玉林琇写了几个字，福临选了一个痴字，法名行痴。
四月，玉林琇请求回去，福临赐给他黄衣、金印，派遣官员送他回去，并令使者召玉林琇弟子茆溪行森去京师。福临又封憨璞聪为明觉禅师。由于憨璞聪的推荐，福临在玉林琇离京前一月即闰三月遣使往浙江宁波天童寺召龙池派另一位名僧木陈道忞进京。这年七月茆溪行森应召到京。福临是从玉林琇语录中发现茆溪行森偈语最好，特指名将其召来。福临在万善殿接见茆溪行森，问答佛法过程中，福临不断地点头叫好。
福临自亲政一开始，也曾雄心勃勃，力图振兴国祚，政治一新，但却力不从心，致使矛盾重重，他已疲惫不堪了。在董鄂妃未薨逝前，他曾对弘觉道忞禅师说：“老和尚在朕三十岁的时候来为朕祝寿，也许可以等到。玉林琇说来给朕祝四十大寿，朕绝不会等到了。”他已自觉骨瘦如柴，体力不支，难以挨到四十岁，顶多勉强可以活到三十。他的精神支柱已轰然坍塌，已觉不久于人世，再也无力支撑这座辉煌的帝国大厦了。