玄武门之役发生之后，作为皇上最重要的亲信裴寂的处境就变得非常的尴尬了。这一天他又一次来到太极宫，很显然玄武门之役对皇上的打击实在是太大了，不但整个人看起来苍老了许多，表情凄怆，眼睛里却再也流不出泪水。裴寂上前行礼，皇上叹口气说：“你把尚书左仆射的位置辞了吧！”裴寂一脸不情愿，皇上说：“但你应该辞掉尚书左仆射的位置，我也会退位，让二郎他们这些人去折腾吧！”裴寂说：“皇上，臣不甘心，臣不能让武德朝就这么完了。”皇上冷笑着说：“没有武德朝了。”裴寂说：“可眼下秦王并没有让皇上退位的意思。”皇上忍不住哈哈大笑，说：“事情都已经做到了这个地步，还需要人家把话挑明吗？你要识时务知进退，听我的话没有坏处。”
裴寂说：“皇上，我听说秦王已经采取天下和解之计，即使我曾经支持过建成，他也不会跟我计较。”一听这话皇上瞪圆了双眼，用手指着他的脸说：“你可别忘了刘文静是怎么死的？”裴寂说：“那可是皇上下旨杀的呀！”皇上说：“我是他的老子，他能拿我怎么样，可你就不一样了，他会把所有的气都出在你身上。”裴寂说：“如果真有那么一天，皇上一定要帮我。”皇上说：“你可曾记得当初世民也是苦苦哀求，可还是心一横杀了刘文静。”裴寂一下子不知道该说什么了，皇上说：“如果你能够识时务，交出尚书左仆射的位置，我就有办法保全你的荣华富贵，我还能让你继续留在长安，千金易得，知己难求。我是完全出于一番好意，你可不要听不进去。”裴寂叹一口气说：“既然皇上这么说了，臣还有什么可拒绝的呢？”明日朝会，裴寂请辞，皇上给了他一个特进的身份，允许他继续留在皇帝身边当差。
不久之后，秦府派人给皇宫送来了一份非常重要的文件。皇上打开一看，上面写着秦琼为左武卫大将军，程咬金为右武卫大将军，尉迟恭为左后候大将军，萧瑀为尚书左仆射，房乔为中书令，长孙无忌为吏部尚书，杜如晦为兵部尚书，封伦为尚书右仆射。皇上立刻用主笔在上边批了一个准字，不久之后皇上正式下旨，册立世民为皇嗣，长孙氏为皇嗣妃。册立皇嗣的仪式在太极宫武德殿举行，皇上坐在御座之上，看着下面发生的每一幕，一副慈祥与欣慰的表情。仪式结束之后，来到后宫眼泪夺眶而出。裴寂跟在他的身后看到了这一幕，说：“皇上，事情已经发生了，徒劳悲伤没有用处，日子总还要过下去。”皇上说：“悔不该立建成为皇嗣，你说皇帝那个位置真的就那么吸引人吗？为什么千百年来一直要为此骨肉相残？”
裴寂坐下来看着皇上，一时不知道该说什么，皇上接着说：“朕做梦也想不到当初发生在文皇帝身上的事情会发生在朕的身上。”裴寂说：“皇上，许多人都说世民与当初前朝的太上皇非常相似，其实二者之间还是有很多的不同。”皇上眼皮都没有抬自顾自的说：“事情都已经做到这个地步，还有什么不同呢？我真的担心大唐也会二世而亡。”裴寂说：“相比于在扫平环宇的战争当中，世民的功劳十倍于当初的太上皇不止。在攻下南陈之后，纳萧皇后为妃，而世民打下那么多地方，还没有做过这样的事情。”皇上摇摇头说：“你可能忘了，在秦府之中就有一位隋朝的公主。”裴寂说：“与之相比，前者更胜于文辞，而后者更胜于武略。”皇上说：“隋朝之所以灭亡，与当初太上皇好大喜功有很大的关联。”
裴寂说：“皇上，只要老臣有一口气在，就一定要扶保大唐，不重蹈隋朝的覆辙。”皇上白了他一眼说：“你还是算了吧！到了如今这个时候，他还能听得清你说的话。”没过多久，秦府的团队平移到了东宫，不过皇嗣的府邸亲王的府邸还是有着很大的不同，苗怀仁和他的家人没有办法继续跟世民住在一起了，为了能够方便让苗怀仁来东宫做事，世民让人帮助他在皇城附近的平康坊租了一处房屋。这个地方位置极为特殊，出入的人员成分非常的复杂。苗怀仁被安排的这个地方还有一个重要的理由，就是要以此地为窗口，了解长安一些重要人士的动向。刚搬来这个地方的时候一时半会儿还适应不了，不知道如何跟左邻右舍相处，同时又担心疏远了与世民一家之间的关系，但是父亲说：“这件事是注定要发生的，如今的皇嗣不是昔日的秦王，我们必须更加重视规矩，不能给皇嗣的脸上抹黑。”
因为担心世民秋后算账，一连数日裴寂坐卧不宁。他派人盯紧了魏征的住宅，看有没有人去拜访他。可一天一天过去了，既没有人去抓捕魏征，也没有消息说不再追究魏征的罪责。正所谓不怕贼偷，就怕贼惦记，刀子老是悬在脑袋上头，心里着实不是滋味。而此时的封伦已经深得新皇嗣的信任，经常被叫去谈论治国之道，似乎已经把他当作是心腹之臣。在裴寂看来，封伦是典型的小人，之前劝皇上杀掉秦王，玄武门之役发生后，转过来又劝秦王要对建成和元吉留下来的旧人赶尽杀绝。一个人造孽如此了，却能够得到前后两位国君的信任。傍晚，裴寂在陪着皇上吃饭的时候，把封伦的事情说了。皇上笑着说：“你还是不清楚自己的处境，从晋阳起兵到现在，你与世民的意见每每相左，你怎么能指望他能听得进去你的金玉良言呢？至于封伦这个人，你不要搭理他，世民身边没有一个人是善茬，他一定会在将来的某一天现出原形。”
无论皇上怎么说，裴寂从始至终都不拿自己当成是局外人。魏征在家里越等心越慌，一边踱步一边说：“秦王的心思真是让人很难猜得透，他到底是要杀我还是要用我呢？”夫人在一旁说：“你现在就像是被猫抓住的老鼠，不玩儿够了，人家不会咬死你。”说的魏征心头一紧，转念一下又说：“不会的，我在很小的时候就有相面的先生给我说过，说我将来一定会是一位著名的贤相。”夫人说：“你还是听我的，咱们赶紧逃命去吧！”就在这个时候，突然有一队全副武装的士兵闯进了魏征的住宅。见到魏征，士兵们退后一步，一位军官来到魏征的面前，拱手说：“奉皇嗣殿下之命，特意来请未夫子去东宫问话。”这个时候夫人一脸紧张，说：“我让你逃你就不逃，现在就是想逃也逃不了了。”
魏征抓住她的手说：“要是我没有办法回来的话，你就一个人走吧！”夫人说：“要是你有个三长两短，我也不活了。”魏征那厢里已经动身，世民在东宫的显德殿静静的等候魏征的到来，秦府的家将和谋士如今都成了朝廷的重臣，魏征步入东宫之后，果然发现今日气氛大不相同。进入显德殿之后每个人都对他怒目而视，魏征心里想横竖不过也就是一死，有什么可怕的呢？于是昂首挺胸来到世民的面前，立而不跪。就在这个时候，他的耳边有一个声音大声呵斥道：“大胆魏征，见到皇嗣殿下还不跪下。”魏征没有理睬，就在这个时候，两位身披重甲的壮士冲上来要按到魏征，世民却示意他们不要过来。他端坐在那里不怒而威，阴森的目光让人不寒而。魏征仔细的端详着这个人，想要看透他到底在想什么。
突然世民大声说：“魏征，我们本是和睦的一家，自你来到长安之后不断挑唆。以至于发生了这样的惨祸，你知罪吗？”魏征无论如何也没想到世民居然会这样质问他，于是心平气和的说：“皇嗣殿下若是听我的话，今日这一场惨祸就不会发生。”世民冷笑着说：“我听说你是建成帐下的忠臣，听说你多次犯颜直谏，现如今建成与元吉故去这么久了，你怎么没有为他们而死呢？”魏征平静的说：“我当初我多次进谏而且帮助他积极谋划刺杀秦王，我已经尽了人臣的本分，所以无需为他们而死。”世民说：“忠臣就该像你这样吗？”魏征说：“我不是忠臣，我是良臣。”话音未落，现场发出一阵哄笑，魏征说：“所谓忠臣，没有办法为主上解除忧患，只知道主死臣死。古往今来，每一个崩溃的皇上都有一些忠臣为他而死。相比之下，良臣更为难得，因为良臣只有英明的主上知他用他，而良臣反过来又能辅佐主上成就一番大事业。”</div>